De dienst healthdata.be biedt de volgende diensten aan: a) het ter beschikkingstelling van gepseudonimiseerde gegevens uit het datawarehouse, b) het migreren naar het healthdata.be-platform van bestaande gepseudonimiseerde gegevensverzamelingen bij zorgactoren en c) de operationalisatie van nieuwe gepseudonimiseerde gegevensverzamelingen bij zorgactoren.

Healthdata.be ontwikkelt software om de registratie van gezondheidsgegevens te faciliteren: HD4DP aan de kant van de gegevensverstrekker, en HD4RES aan de kant van de ontvanger of projectverantwoordelijke. De verzending van gegevens vanuit HD4DP naar HD4RES verloopt via eHealthbox batch codage.